Otro problema que me he encontrado en mi migración a Ubuntu 17.10 es que algunas aplicaciones como la calculadora interceptan el atajo de teclado que debería abrir Guake. No importa si usas F12 o cualquier otra combinación simplemente no funciona.
Para solucionarlo podemos crear un atajo de teclado global en gnome (desde el teclado) con la siguiente instrucción:
/usr/bin/dbus-send --type=method_call --dest=org.guake.RemoteControl /org/guake/RemoteControl org.guake.RemoteControl.show_hide
Este comando lanza la señal que abre Guake en mi caso con la tecla F12. En algunos casos recomiendan eliminar el atajo original pero yo lo he conservado y funciona correctamente.